对于朱元璋这个把死生一直看的很重的人，自从他死后下葬明孝陵开始，各种猜测各种谜团就从未中断…… 朱元璋地宫里的秘密，为迷惑盗墓贼，竟让13座棺椁同时下葬?
1.13座“地宫”
可能朱元璋也觉得自己生前杀了太多的人，害怕死后被人掘墓报应，所以在他归天那天特意摆出了南京13座城门同时开，13个棺椁同时出城的迷魂阵。
相传，埋葬在明孝陵的那个棺椁其实是空的，朱元璋是不会明摆着让盗墓贼进入墓室掘墓的。而他的真身其实被安葬在了南京朝天宫里，这是他特意安排的，而且还调派了重兵驻守此处。另外还有另一种坊间传言称，崇祯帝上吊的地方就是朱元璋的埋葬之处，崇祯帝是去见他的老祖宗朱元璋领罪去了。总之，关于其真身在哪，历来说法真真假假谁也搞不清。
2.两个“神宫监”
按照规定，皇帝死后安息的地方叫做神宫，而在明朝管理神宫的机构是中央专门设立的叫做神宫监，并且规定神宫监必须靠近神宫，可还不能在神宫内部，因为皇陵内部不能轻易进出。明朝灭亡几百年过去了，皇陵连同神宫监也缺少修缮，如今早已灰尘累累。在这几年的挖掘工作中，考古学家发现了在皇陵附近竟然出现了两座神宫监遗址，这是不可想象的。
3.骇人听闻的秘密机关
为了避免陵墓被盗墓贼挖掘，所以朱元璋在生前就秘密派遣了大批通晓制作机关的能人异士前往皇陵进行设计。据野史记载，仅仅进入墓室就要经过多达8道机关，像一触即万箭齐发的机弩、镶嵌在大门上的拐钉更是不计其数。最让人害怕的还数尸毒这一奇巧淫术，相传只要被尸毒所染，不久就会皮肤溃烂，失去知觉，更有甚者很快就会全身僵硬。如果毒液扩散至大脑，那么人就会转化为僵尸，而且饥不择食。
朱元璋去世至今已经数百年了，可是古今中外的探索者依旧没有找到他真实的墓穴。或许这也从侧面表现出了朱元璋的心思缜密和别的帝王所不及之处吧。