对于这种说法，科学家们无从考证，但当科学不能对一些神秘现象做出合理解释时，这种推测反而更容易让人接受，或许它真是外星人的杰作呢。
而水晶头骨中最神秘的米歇尔黑吉斯水晶头骨更是聚集了种种神秘现象和不解之谜。但实际上，这颗头骨并不是第一个也不是唯一一个被发现的头骨。到目前为止，世界上总共发现了大约十几颗水晶头骨，其中有3颗保存在博物馆或研究机构内，其余都被私人收藏。而且，这十几颗水晶头骨也不全是玛雅人的遗物。但是在所有的这些头骨中，米歇尔.黑吉斯头骨无疑是纯度最高、最完美也最神奇的一个。
也许正因为这颗头骨太完美了，以至于遭到了人类的妒嫉，让人怀疑起它的真实来历。尤其是这个水晶头骨的具体出土时间，安娜本人竟有不同的说法。
她在 1962年接受采访时说，水晶头骨是在30年代末，由她的父亲在一次挖掘玛雅遗址的时候发现的;1968年，她给一个研究水晶头骨的专家写信时又说头骨是在1926年发现的;1982年，她回答学者尼克尔的询问时，又变成是1924年;在1995年出版的《水晶头骨之谜》里面，又说水晶头骨是在安娜17岁生日那一天发现的。这些，都不得不让人怀疑米歇尔.黑吉斯水晶头骨的真实来历。
科学家们认为，水晶是一种神奇的东西，很容易令人着迷，另外，头骨也很容易让人联想到死神和死亡，用水晶来雕刻头骨，这种催眠的作用一下子就加倍了，所以容易受到暗示的人就会被它催眠，产生幻听、幻觉。一起震惊考古界的事件发生了:英国大英博物馆的墨西哥古阿兹特克人的水晶头骨被科学家正式鉴定为是赝品，考古界为之哗然。