事后人们提出了许多疑问，比如：在相隔半小时的两次呼救信号中，“马埃纳号”的船员怎么没能逃生？他们为什么两次都不报出自己的船名和方位？也许那些穿着救生衣的人是被淹死的？可遇难地点离海岸只有一哩，为什么船上那些水性娴熟的船员竟连一个也没能游到岸边？
还有人推测说他们是饿死的。但是这似乎站不住脚，因为最先被捞上来的那7名船员在海里顶多呆了9个小时，这么短的时间，一般是不大可能饿死人的。还有一种认为船上发生过爆炸事故的假设也可以推翻，因为捞上来的尸体完全没有伤痕。
任凭人们如何猜测，制造了这场灾难的大海一直保持着沉默。